Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms