Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smad9Q9JIW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smad9Q9JIW5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms