Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1Q9JIT0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms