Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1fQ9JIS7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms