Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp4Q9JIL5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp4Q9JIL5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tulp4Q9JIL5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms