Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gtf2ird1Q9JI57 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms