Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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Tmod3Q9JHJ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
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Tmod3Q9JHJ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tmod3Q9JHJ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tmod3Q9JHJ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmod3Q9JHJ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tmod3Q9JHJ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tmod3Q9JHJ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tmod3Q9JHJ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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