Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM39BQ9GZU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms