Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms