Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ropn1Q9ESG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1Q9ESG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms