Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms