Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ParvbQ9ES46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ParvbQ9ES46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ParvbQ9ES46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ParvbQ9ES46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ParvbQ9ES46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ParvbQ9ES46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvbQ9ES46 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms