Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenofQ9ERR7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms