Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrnb2Q9ERK7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrnb2Q9ERK7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms