Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Ndst3Q9EQH7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Ndst3Q9EQH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Ndst3Q9EQH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Ndst3Q9EQH7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Ndst3Q9EQH7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndst3Q9EQH7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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