Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp2Q9EPK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms