Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r54Q9EPB8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms