Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aph1cQ9DCZ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aph1cQ9DCZ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms