Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms