Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx6Q9DBY5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms