Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ftsj3Q9DBE9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms