Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tysnd1Q9DBA6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tysnd1Q9DBA6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms