Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2bQ9DAC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm2bQ9DAC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm2bQ9DAC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms