Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tmem239Q9DA47 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tmem239Q9DA47 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tmem239Q9DA47 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tmem239Q9DA47 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tmem239Q9DA47 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmem239Q9DA47 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmem239Q9DA47 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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