Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9W6

Fam217a, Protein FAM217A, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam217aQ9D9W6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam217aQ9D9W6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam217aQ9D9W6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam217aQ9D9W6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam217aQ9D9W6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam217aQ9D9W6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms