Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd9Q9D9M4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzd9Q9D9M4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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