Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D9D9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D9D9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9D9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9D9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms