Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg7Q9D906 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms