Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlirpQ9D8T7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms