Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnajc4Q9D844 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc4Q9D844 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms