Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4cQ9D7F7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms