Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn23Q9D7D7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms