Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop56Q9D6Z1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop56Q9D6Z1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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