Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MsraQ9D6Y7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms