Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc39Q9D5Y1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms