Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930449I24RikQ9D5E3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms