Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc130Q9D516 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms