Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc83Q9D4V3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms