Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms