Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms