Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrnp35Q9D384 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms