Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2bQ9D1Y9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms