Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syf2Q9D198 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms