Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed3Q9D0L1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms