Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NkapQ9D0F4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NkapQ9D0F4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms