Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmss1Q9CZT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms