Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp2Q9CYZ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms