Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms