Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms