Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms